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„Star Trek: Lower Decks“ konzentriert sich auf die Hilfsmannschaft, die im Jahr 2380 auf einem der unwichtigsten Schiffe der Sternenflotte, der USS Cerritos, dient. Die Fähnriche Mariner, Boimler, Rutherford und Tendi müssen ihre Pflichten und ihr Privatleben unter einen Hut bringen, oft unterwegs und erschüttert durch eine Reihe von Science-Fiction-Anomalien. Die Brückenbesatzung des Schiffs besteht aus Captain Carol Freeman, Commander Jack Ransom, Lieutenant Shaxs und Doctor T’Ana. Dies ist der zweite animierte Spin-off der Serie nach „Star Trek: The Animated Series“ aus den Jahren 1973-1974, aber er hat einen entschieden erwachseneren Ton und Humor.